কাস্টম হাউস আইসিডি, কমলাপুর, ঢাকার কার্যক্রম জাতীয় রাজস্ব বোর্ডের কাস্টমস অনুবিভাগের অধীনে পরিচালিত । প্রত্যক্ষ ও পরোক্ষ কর আদায়ের সংস্থা জাতীয় রাজস্ব বোর্ড, অর্থ মন্ত্রণালয়ের অভ্যন্তরীণ সম্পদ বিভাগের অন্তর্গত । কাস্টম হাউস আইসিডি, কমলাপুর, ঢাকা মূলত: আমদানি ও রপ্তানি পর্যায়ে কাস্টমস শুল্ক ও অন্যান্য কর আদায়ে দায়িত্বপ্রাপ্ত। রাষ্ট্রীয় মূল্যবান রাজস্ব সংগ্রহের পাশাপাশি কাস্টম হাউস আইসিডি বাণিজ্য  সহজীকরণ, সরকারী প্রবিধানের সুষ্ঠ পরিপালন নিশ্চিত করণার্থে বাস্তবায়ন কার্যক্রম পরিচালনা, সামাজিক, পরিবেশ ও জাতীয় ঐতিহ্য প্রতিরক্ষণ, বৈদেশিক বাণিজ্যের পরিসংখ্যান প্রস্তুত ও রক্ষণের জন্য দায়িত্বপ্রাপ্ত।